目前，美术学院设有染织服装艺术设计系、陶瓷艺术设计系、视觉传达设计系、环境艺术设计系、工业设计系、信息艺术设计系、绘画系、雕塑系、工艺美术系、艺术史论系、基础教研室等11个教学单位；综合办公室、教务办公室、科研办公室、国际合作与交流办公室、学生与校友事务办公室、离退休人员事务办公室等职能部门；培训中心、清华大学艺术与设计实验教学中心、《装饰》杂志社等单位；清华大学艺术与科学研究中心等4个校级研究中心，另有35个研究所。